A Napfény InterCityk 20-40 perccel hosszabb menetidővel közlekednek a szegedi fővonalon, mert Balástya és Szatymaz között csak korlátozással, lassabban közlekedhetnek a vonatok biztosítóberendezési hiba miatt.
A hosszabb menetidő és az egyvágányú közlekedés sajátosságai miatt a vonattalálkozások eltolódnak, ezért a vonatok esetenként hosszabb ideig tartózkodhatnak az állomásokon.